FASTQ是一种存储了生物序列（通常是核酸序列）以及相应的质量评价的文本格式。
它们都是以ASCII编码的。现在几乎是高通量测序的标准格式。NCBI Short Read Archive也是这格式，多了一些描述性词汇而已。格式示例如下：
@SEQ_ID
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
!''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65第一行@后面是描述性文字；
第二行是原始的数据；
第三行是描述性的+号；
最后一行是对第二行相应位置的质量评估。
详细的如Illumina软件格式，NCBI Short Read Archive格式，质量评价标准，ASCII详细编码等请看这里。
本文由 Bin 创作